基本的なセットアップ方法は

http://ubuntuforums.org/showthread.php?t=236093

が参考になると思います。

まず、DNSは指定されたインタフェース（eth0など）しか応答しないのは、どこに設定できますか？

/etc/bind/named.confなどに、

 listen-on   {
        127.0.0.1;
    };

などとしてください。IPアドレスは利用したいインターフェースのものを指定します。

それで、zoneなどの設定は、ちょっと面倒ですので、自動的に設定できますか？

基本的にはできないので、適宜手で編集してください。
GUIなどで設定するツールもあるのかもしれませんが、実際にやってみるとたいした手間では
ありません。