#2の方法では最新のiPhone / iPod touchと認識しなかったりするんで…
[アプリケーション]→[アクセサリ]→[端末]より、

$ gksudo add-apt-repository ppa:pmcenery/ppa && gksudo apt-get update && gksudo apt-get install gvfs gvfs-backends gvfs-bin gvfs-fuse libgvfscommon0 ifuse libgpod-common libplist++1 libplist-utils python-plist libusb-1.0-0 libusbmuxd1 usbmuxd libimobiledevice-utils

と入力して、画面の指示にしたがってください。インストールできましたら、

$ gksudo gedit /etc/fuse.conf

と入力し、「#user_allow_other」を「user_allow_other」にします。
次に、[システム]→[システム管理]→[ユーザとグループ]をクリックして、鍵ボタンをクリックします。
そして、貴方のユーザ名が選択されていることを確認してから、「グループの管理」ボタンをクリックします。
次に、fuseを選択して、プロパティをクリックし、あなたのユーザ名にチェックを入れて、全てのダイアログを閉じます。
そして再起動すれば、iphoneとPCをUSBで接続すれば自動的に認識するでしょう。
同期はgtkpodとか使えばいいと思います。