それと、RemastrsysのメニューからCleanを実行するのが正しい方法です。
もう二度と使わないって場合は削除でもいいと思いますけど。
あと、管理者権限のnautilusで削除したデータはずべてこのフォルダに入ってしまいます。
そして、このキャッシュフォルダから削除しても、キャッシュフォルダにまた入ります。
なので、Shiftキーを押しながら、Del（ノートPCの場合。）で完全削除するくせを付けないと難しいでしょう。
（正確には、ゴミ箱に入っているのですが、rootでは、ゴミ箱に正常にアクセスできないので、完全削除しかありません。）
ただ、管理者権限でなんらかの削除をした場合、一度再起動して、正常に作動することを確認してから、完全削除という形をおすすめします。

> このキャッシュフォルダから削除しても、キャッシュフォルダにまた入ります。

$ sudo rm -R /root/.local/share/Trash

Trashは使用時には空で再生成されます。