mush219様

「アプリケーション」ボタンのメニューの編集の中をいじっていたら、ボタンを押しても何も表示されなくなってしまいました。

とのことですが、端末にて下記を実行してみて下さい。

update-menus

実行後、一度logoutしてloginし直してみて下さい。
その結果を再度ご投稿下さい。あとはPreferencesかAdministrationの中に「Main Menu」というツールがあるかも知れません。これにてアプリケーションメニューにチェックが入っているかどうかも確認が必要かも知れませんね。

[元に戻す]ボタンを押すと通常、メニューは初期状態に戻ってしまいますけどね。

非常に申し訳ありません。自己解決しました。
ので、ここに解決した方法を書いておきます。
「homeディレクトリの.configというディレクトリを消して、Xを再起動」で無事アプリケーションのところを押すとちゃんと表示しれくれるようになりました。みなさんありがとうございました。