自分で確認してきました。

isoからCD作成して試したところ、プライバシーの項目がありました。
また、mozcですがカタカナ英語辞書にチェックが入っているが、変換候補に現れないことがわかりました。
恐らくアップグレードの過程で辞書ファイルなど必要なものが消えた or 破損したのかも知れません。

SynapticでNautilus・Ibus・mozc関連を再インストールしてみましたが状況は変わりませんでした。
また、質問した時は気づかなかったのですが、新規インストール時から入っていた上海のゲームが消えていました。

CPU Core2 Quad Q9550 2.83GHz　/ メモリ 4GB / HDD 500GB
2009年に購入したPCなので、そんなに古くはないはずなのですが。。。
アップグレード前にアップデートも済ませ、ディスクにエラーがないことも確認しています。

今までは"カーネルクラッシュ" or "インストール後の再起動から画面真っ暗で操作不能"のどちらかだったので、今回は健闘したと思います。
しかし、通常使用は問題ないのにアップグレードだけ失敗する理由がわかりません。
アップグレード前に確認しておくべき項目があれば、ぜひお教えください。

せっかくCD作成したので、今回も再インストールすることにします。

すみません、ウソつきました。
Synapticで検索したところ無かったので、無いと返答してしまいました。
下記のコマンドでよろしいでしょうか？

>apt-cache show activity-log-manager-control-center
Package: activity-log-manager-control-center
Priority: optional
Section: utils
Installed-Size: 289
Maintainer: Siegfried-Angel Gevatter Pujals <[email protected]>
Architecture: amd64
Source: activity-log-manager
Version: 0.9.4-0ubuntu3
Replaces: whoopsie (<= 0.1.10)
Depends: libc6 (>= 2.2.5), libcairo2 (>= 1.2.4), libgdk-pixbuf2.0-0 (>= 2.22.0), libgee2 (>= 0.5.0), libglib2.0-0 (>= 2.31.8), libgnome-control-center1 (>= 1:2.91.2), libgtk-3-0 (>= 3.1.4), libpango1.0-0 (>= 1.22.0), libpolkit-gobject-1-0 (>= 0.99), libzeitgeist-1.0-1 (>= 0.3.2), activity-log-manager-common (= 0.9.4-0ubuntu3), zeitgeist-core (>= 0.8~) | zeitgeist (>= 0.8~)
Breaks: whoopsie (<= 0.1.10)
Filename: pool/main/a/activity-log-manager/activity-log-manager-control-center_0.9.4-0ubuntu3_amd64.deb
Size: 74078
MD5sum: e2105ba9a0e726aa2c8e8419252915f6
SHA1: 39eeea061e38cbd821bbbee51031bde65056a367
SHA256: 0f295f3391f4059219c2213c493a78f5f3d4db26fac3e087da1abb877fa9becd
Description-en: blacklist configuration for Zeitgeist (control center integration)
Zeitgeist is a service which logs the user's activities and events (files
opened, websites visited, conversations held with other people, etc.) and
makes the relevant information available to other applications.
.
It serves as a comprehensive activity log and also makes it possible to
determine relationships between items based on usage patterns.
.
This package contains the gnome control center integration.
It lets you control what gets logged by Zeitgeist. It supports setting up
blacklists according to several criteria (such as application or file types),
temporarily stopping all logging as well as deleting recent events.
Homepage: https://launchpad.net/activity-log-manager
Description-md5: 7360b3c5ec633391fe047115d0686631
Bugs: https://bugs.launchpad.net/ubuntu/+filebug
Origin: Ubuntu
Supported: 5y
Task: ubuntu-desktop, ubuntu-usb, edubuntu-desktop, edubuntu-usb

双方を比較して足りないものをインストールすれば、同等になるだろうということですね。
とりあえずactivity-log-manager-control-centerはある様だが、システム設定→プライバシーアイコンがないという状況のようでした。

diffで比較した結果ですが、今回の件に関するものは無さそうです。

131a132,133
> espeak                        install
> espeak-data                    install
529c533
< libespeak1                    deinstall
---
> libespeak1                    install
1068,1069d1067
< linux-headers-3.2.0-24                install
< linux-headers-3.2.0-24-generic            install
1071c1069
< linux-image-3.2.0-24-generic            install
---
> linux-image-3.2.0-23-generic            install
1089a1088
> manpages-ja                    install
1326a1322
> speech-dispatcher                install
1342d1337
< tcl8.5                        install

本日、問題ありのディスクから起動してみると、システム設定→プライバシーアイコンがないのは変わりませんが、Dashのインストール済みアプリケーションの中にプライバシーがありました。
昨日は無かったはずですが…見落としかもしれません。

しかし、Dashからプライバシーをクリックしても何も起動しません。
それ以外は問題なく起動しました。

また、Synapticでも「activity-log-manager-common」と「activity-log-manager-control-center」の2つがありました。
昨日は「activity-log-manager-control-center」で検索かけても何もなかったのですが。。。

そこで、この2つを再インストールすればよいと思い、適用ボタンを押したら画面が乱れてフリーズ・操作不能になってしまいました。

1時間ほど放置したのですが、回復する兆しもないので強制終了しました。
再び起動すると、画面真っ暗でキーボード・マウスどちらも反応なしです。

やむなくOS再インストールしました。
現在はシステム設定→プライバシーアイコンもあり、Dashからでも起動します。
ディスクエラーもなく、再起動もしてみましたが問題なく動いています。
ただ、mozcでカタカナ英語・郵便番号変換できない点は変わりません。。。